vaccine efficacy test fails
@@ -254,15 +254,15 @@ def test_vaccine_target_eff():
self.placebo_inds = eligible[cv.choose(len(eligible), min(self.trial_size, len(eligible)))]
return
- pars = {
- 'pop_size': 20000,
- 'beta': 0.01,
- 'n_days': 90,
- 'verbose': -1,
- }
+ pars = dict(
+ pop_size = 40_000,
+ beta = 0.01,
+ n_days = 90,
+ verbose = -1,
+ )
# Define vaccine arm
- trial_size = 4000
+ trial_size = 8_000
start_trial = 20
def subtarget(sim):
@@ -390,14 +390,14 @@ if __name__ == '__main__':
cv.options.set(interactive=do_plot)
T = sc.tic()
- sim1 = test_states()
- msims1 = test_waning(do_plot=do_plot)
- sim2 = test_variants(do_plot=do_plot)
- sim3 = test_vaccines(do_plot=do_plot)
- sim4 = test_vaccines_sequential(do_plot=do_plot)
- sim5 = test_two_vaccines(do_plot=do_plot)
+ # sim1 = test_states()
+ # msims1 = test_waning(do_plot=do_plot)
+ # sim2 = test_variants(do_plot=do_plot)
+ # sim3 = test_vaccines(do_plot=do_plot)
+ # sim4 = test_vaccines_sequential(do_plot=do_plot)
+ # sim5 = test_two_vaccines(do_plot=do_plot)
sim6 = test_vaccine_target_eff()
- res = test_decays(do_plot=do_plot)
+ # res = test_decays(do_plot=do_plot)
sc.toc(T)
print('Done.')
